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生物医学NLP领域的特定预训练模型:PubMedBERT

2023-11-27
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今年大语言模型的迅速发展导致像bert这样的模型现在被称为“小”模型。在kaggle的llm科学考试比赛中,使用deberta的选手获得了第四名,这是一个非常出色的成绩。因此,在特定领域或需求中,并不一定需要大型语言模型作为最佳解决方案,小型模型也有其用武之地。因此,今天我们要介绍的是pubmedbert,它是微软研究院于2025年在acm上发布的一篇论文,该模型通过使用特定领域的语料库进行bert的从头预训练

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生物医学NLP领域的特定预训练模型:PubMedBERT

以下是论文的主要要点:

对于具有大量未标记文本的特定领域,例如生物医学领域,从头开始预训练语言模型比持续预训练通用领域语言模型效果显著。为此,我们提出了生物医学语言理解与推理基准(BLURB),用于特定领域的预训练

PubMedBERT

1、特定领域Pretraining

生物医学NLP领域的特定预训练模型:PubMedBERT

研究表明,从头开始的特定领域预训练大大优于通用语言模型的持续预训练,从而表明支持混合领域预训练的主流假设并不总是适用。

2、模型

利用BERT模型,对于掩码语言模型(MLM),全词屏蔽(WWM)的要求是必须屏蔽整个词

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3、BLURB数据集

生物医学NLP领域的特定预训练模型:PubMedBERT

据作者介绍,BLUE[45]是在生物医学领域创建NLP基准的第一次尝试。但BLUE的覆盖范围有限。针对基于pubmed的生物医学应用,作者提出了生物医学语言理解与推理基准(BLURB)。

生物医学NLP领域的特定预训练模型:PubMedBERT

PubMedBERT使用更大的特定领域语料库(21GB)。

生物医学NLP领域的特定预训练模型:PubMedBERT

结果展示

生物医学NLP领域的特定预训练模型:PubMedBERT

在大多数生物医学自然语言处理(NLP)任务中,PubMedBERT一直表现优于其他所有BERT模型,并且通常具有明显的优势

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